File lockFile = new File("file.lock");
    int retryCount = 30;  // timeout = 3sec
    while (! lockFile.createNewFile()) {
        if ((retryCount--) == 0) {
            throw new LockFailedException("give up!");
        }
        Thread.sleep(100);
    }
    try {
        // ファイルロックで保護された処理
        ...
    } finally {
        lockFile.delete();
    }